A Víztudományi és Vízbiztonsági Nemzeti Laboratórium (VVNL) célja, hogy átfogó támogatást nyújtson az integrált vízgazdálkodás területén. Tevékenységei kiterjednek a vízfolyások (folyók és árterek), nagy kiterjedésű sekély tavak, felszín alatti vizek, valamint a regionális, mezőgazdasági és városi vízgazdálkodás kérdéseire. Emellett foglalkozik a szennyvízelvezetés és a vízgyűjtők vízminőségének értékelésével, elősegítve a Víz Keretirányelv (VKI) célkitűzéseinek megvalósítását. A Balatoni Limnológiai Kutatóintézet, mint konzorciumi partner, nemzetközi szintű kutatásokat és módszertani fejlesztéseket végez az édesvízi élőlényközösségek szerveződése, valamint a vízi anyag- és energiaáramlás feltárása terén, különös tekintettel az emberi tevékenységek hatásaira. Fontos küldetése továbbá a kutatói utánpótlás biztosítása hallgatók és fiatal kutatók szakmai támogatásán keresztül.