A HUN-REN Balatoni Limnológiai Kutatóintézet Molekuláris Biológiai Laboratóriumában a tudomány modern eszköztárát hívjuk segítségül ökológiai kérdések megválaszolásához. Hazai és nemzetközi együttműködésben a fokozottan védett eurázsiai vidra (Lutra lutra) táplálkozását szeretnénk jobban megismerni.
A vidra Magyarországon a vizes élőhelyek csúcsragadozója, így nagy hatást gyakorol az ökoszisztémára, azonban természetvédelmi és halgazdálkodási szempontból halfogyasztó szerepe ellentmondásos megítélésű. A vidrákat ritkán lehet megfigyelni, ezért kevés információ áll rendelkezésre arról, mit is esznek valójában. Ezért fordultunk a DNS-alapú elemzéshez, amely során a kutatásban korábban gyűjtött, elpusztult vidrákat vizsgáltunk.
Laborunkban a gyomortartalom mintázása után annak DNS-molekuláit kinyerjük, majd a DNS adott szakaszait felsokszorozzuk (PCR) és bázissorrendjét (szekvencia) meghatározzuk. Ezzel az egyedi “vonalkóddal” azonosítjuk, hogy milyen zsákmányállatok alkotják a vidrák étrendjét. Az általunk használt ún. nanopórus szekvenálás egy kiemelkedően innovatív módszer, mely során egy mindössze Balaton szelet méretű eszközben történik a szekvenálás. Néhány csepp mintát az eszközbe töltünk, ahol a DNS-molekulák apró pórusokon haladnak át, miközben az elektromos áram változásait érzékelve határozható meg a szekvencia.
A munka a Nemzeti Virológiai Laboratórium, Pécsi Tudományegyetem kollégáival való együttműködésben zajlik, a gyakorlati tudáscserét és a szakmai kapcsolatot erősítve. Nemzetközi szinten a Basecamp Research csapata segíti a munkánkat — többek között gyakorlati oktatással, a Nanopore MinION készülék, fontos reagensek és számítástechnikai erőforrások biztosításával.
A vidrák táplálkozását vizsgáló kutatás jól mutatja, hogyan dolgozunk azon, hogy új, modern tudományos módszereket fejlesszünk. Ezek a molekuláris ökológiai módszerek segítenek jobban megérteni a természet működését, a fajok sokféleségét és azt, hogyan lehet hatékonyabban figyelni a környezet állapotát.
A kutatás eredményeiről, vagyis arról, mit is esznek valójában a vidrák, hamarosan beszámolunk.
